Apa itu Endonuklease

Endonuklease adalah enzim yang mampu memotong rantai DNA atau RNA pada titik tengahnya dengan memutus ikatan fosfodiester. Endonuklease juga disebut enzim restriksi karena mereka digunakan dalam eksperimen untuk memotong untaian bahan genetik pada titik-titik tertentu. Sebaliknya, eksonuklease menurunkan rantai basa nitrogen dari ujungnya.

Setiap endonuklease mampu mengenali urutan spesifik untai RNA atau DNA, yang jumlah basa bervariasi dengan masing-masing endonuklease dari 4 basa menjadi selusin. Beberapa dari mereka sangat membatasi dengan urutan yang mereka potong, sementara yang lain memungkinkan variasi dalam urutan yang mereka kumpulkan.

Urutan yang endonuklease kenali sangat bervariasi, meskipun kebanyakan dari mereka adalah palindromik, sehingga pengakuan dapat dilakukan di salah satu dari dua untai DNA. Enzim restriksi dapat dibagi antara yang menghasilkan potongan lurus atau tumpul dalam urutan DNA dan yang meninggalkan ujung 3 ′ atau 5 lebih panjang dari yang lain.

Di alam: semua makhluk hidup mengandung endonuklease yang bertindak sebagai pertahanan terhadap kemungkinan invasi DNA atau RNA yang berasal dari luar (bakteri atau virus). Tipe intron IV dihapus dari urutan RNA berkat endonuklease yang bekerja pada target tertentu.

Selama replikasi DNA, adalah umum untuk kesalahan terjadi ketika memperkenalkan basa baru, ketika ini terjadi endonuklease nonspesifik dibawa oleh protein lain ke kesalahan untuk menghilangkan basa yang salah dan kemudian menambahkan yang mereka sentuh dengan polimerase.

Ada 3 jenis endonukleas: tipe I dan III mampu, selain memotong untuk memodifikasi basa dengan mencampurkannya. Tipe I memotong dalam urutan yang mereka kenali, sementara tipe I memotong antara 5 dan 10 basa dari target pengenalan. Selain itu, kelompok-kelompok ini membutuhkan input energi (ATP) untuk bergerak di sepanjang rantai DNA sambil mengenali urutannya. Sebaliknya, endonuklease tipe II tidak membutuhkan ATP, walaupun mereka membutuhkan kehadiran ion magnesium (Mg ++) dan hanya mengenali sekuens yang sangat spesifik.

Kegunaan di laboratorium: beberapa endonukleas digunakan untuk memotong untaian DNA dengan tujuan yang sangat berbeda. Di antara mereka, kami menyoroti rekombinasi dengan memotong dua DNA dengan enzim yang sama dan kemudian menghubungkan ligase satu sama lain dengan enzim lain.

Ada daftar besar enzim restriksi yang disebut oleh inisial spesies, biasanya bakteri yang diekstraksi dan kemudian angka dalam digit Romawi, yang mengacu pada berapa banyak endonuklease berbeda dapat diperoleh dari spesies yang sama.

Beberapa yang paling umum dengan EcoI atau EcoV, yang berasal dari bakteri Escherichia coli. Sebagai contoh, HindIII disintesis dari bakteri Haemophilus influenzae, walaupun karena rendahnya produksi bakteri ini, lebih sering untuk memperkenalkan gen dalam E. coli sehingga ia mensintesis enzim, untuk pemurnian berikutnya.

Loading...

Tinggalkan Balasan

Alamat email Anda tidak akan dipublikasikan. Ruas yang wajib ditandai *