Perbedaan yang jelas dari mereka, rekombinase serin dan tirosin yaitu dalam rekombinase serin, serin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi, sedangkan pada rekombinase tirosin, tirosin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang. DNA selama rekombinasi situs-spesifik.
Rekombinasi spesifik-situs (rekombinasi spesifik-situs konservatif) adalah jenis teknik rekombinasi genetik di mana pertukaran untai DNA terjadi antara segmen yang memiliki tingkat homologi urutan tertentu. Rekombinasi spesifik lokasi mengatur proses rekombinasi spesifik lokasi.
Enzim-enzim ini dikelompokkan menjadi dua keluarga sebagai keluarga serin rekombinase dan keluarga tirosin rekombinase. Nama-nama tersebut berasal dari residu asam amino nukleofilik yang ada dalam dua kelas rekombinase di atas yang digunakan untuk menyerang DNA dan yang menjadi terikat secara kovalen dengannya selama pertukaran untai dalam rekombinasi spesifik lokasi.
ISI
- Ikhtisar dan Perbedaan Utama 2.
Apa itu Serine Reco mbinase 3. Apa itu Tyrosine Recombinase4.
Kesamaan Antara Serin dan Tirosin Rekombinase5. 5.
Perbandingan Berdampingan – Serine & Tyrosine Recombinase dalam Bentuk Tabular6. Ringkasan
Pengertian Serine Recombinase?
Dalam metode rekombinasi spesifik lokasi, dua sekuens DNA pendek (“situs target”) dipotong pada titik tertentu di kedua untai, dan ujung potongan digabungkan kembali ke mitra baru.
Teknologi rekombinasi spesifik lokasi, merupakan istilah yang mengacu pada alat genomik dalam rekayasa genetika yang bergantung pada enzim rekombinase untuk menggantikan bagian target DNA. Banyak sistem rekombinasi spesifik lokasi telah ditemukan untuk melakukan penataan ulang DNA ini untuk tujuan yang berbeda.
Tetapi semua enzim rekombinase ini milik dua keluarga. Serin rekombinase adalah salah satunya.
Mereka dapat memediasi hingga tiga jenis penataan ulang DNA: integrasi, eksisi, dan inversi. Rekombinase spesifik lokasi seperti rekombinase serin melakukan penataan ulang DNA dengan mengenali dan mengikat urutan DNA pendek (situs target), di mana mereka memotong tulang punggung DNA.
Kemudian, pertukaran dua heliks DNA terjadi dan penyatuan kembali untaian DNA terjadi. Dalam rekombinase serin, serin adalah asam amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi.
Selama pembelahan DNA, ikatan protein-DNA terbentuk melalui reaksi transesterifikasi. Ikatan fosfodiester digantikan oleh ikatan fosfoserin antara gugus 5’fosfat pada tempat pembelahan dan gugus hidroksil dari residu serin yang dilestarikan.
Ikatan baru menyimpan energi yang dikeluarkan untuk membelah DNA di lokasi target. Energi ini kemudian digunakan untuk menggabungkan kembali DNA ke gugus hidroksil deoksiribosa yang sesuai di situs lain.
Contoh rekombinase serin adalah serin resolvases/invertases dan serine integrases.
Pengertian Tirosin Rekombinase?
Tirosin rekombinase, merupakan istilah yang mengacu pada kelas enzim lain yang mengatur rekombinasi spesifik lokasi konservatif. Seperti dijelaskan sebelumnya, rekombinase tirosin juga melakukan penataan ulang DNA dengan cara yang sama dengan mengenali dan mengikat sekuens DNA pendek (situs target), di mana mereka memotong tulang punggung DNA.
Kemudian, terjadi pertukaran dua heliks DNA dan penyatuan kembali untaian DNA. Tetapi dalam rekombinase tirosin, tirosin adalah asam amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi.
Ciri umum dari kelas ini adalah residu tirosin nukleofilik yang dilestarikan yang menyerang DNA-fosfat gunting untuk membentuk hubungan 3′-fosfotirosin. Rekombinase tirosin (A1) dan integrase tirosin (A2) adalah kelompok enzim yang menonjol dalam keluarga enzim tirosin rekombinase.
Apa Persamaan Antara Serin dan Tirosin Rekombinase?
- Mereka, merupakan istilah yang mengacu pada kelas enzim rekombinase.
- Keduanya mengatur rekombinasi spesifik lokasi.
- Mereka adalah protein.
- Reaksi kimia dasarnya sama untuk keduanya.
- Keduanya mengkatalisasi reaksi transesterifikasi.
Apa Perbedaan Antara Serin dan Tirosin Rekombinase?
Dalam rekombinase serin, serin, merupakan istilah yang mengacu pada asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi. Di sisi lain, dalam rekombinase tirosin, tirosin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi.
Jadi, inilah perbedaan utama antara rekombinase serin dan tirosin. Ciri umum rekombinase serin adalah ia membentuk ikatan fosfoserin dengan DNA, sedangkan rekombinase tirosin membentuk ikatan fosfotirosin dengan DNA selama proses rekombinasi spesifik lokasi.
Infografis di bawah ini mencantumkan perbedaan antara rekombinase serin dan tirosin dalam bentuk tabel.
Ringkasan – Serine & Tyrosine Recombinase
Rekombinasi dapat terjadi antara molekul DNA yang serupa seperti pada rekombinasi homolog atau molekul berbeda seperti pada rekombinasi non-homolog. Rekombinasi spesifik-situs, merupakan istilah yang mengacu pada jenis rekombinasi genetik di mana pertukaran untai DNA terjadi di antara segmen-segmen yang memiliki setidaknya tingkat homologi urutan tertentu.
Ini dikatalisis oleh rekombinase. Kebanyakan rekombinase dikelompokkan menjadi dua keluarga: rekombinase serin dan rekombinase tirosin.
Serin rekombinase menggunakan serin sebagai asam amino nukleofilik untuk menyerang DNA selama proses rekombinasi spesifik lokasi. Tirosin rekombinase menggunakan tirosin sebagai asam amino nukleofilik untuk menyerang DNA selama proses rekombinasi spesifik lokasi.
Oleh karena itu, inilah perbedaan utama antara rekombinase serin dan tirosin.
Referensi:
- “Rekombinasi Spesifik Situs.” Wikipedia, Wikimedia Foundation, 30 Des. 2020, Tersedia di sini.
2.
Grindley, Nigel DF “Mekanisme Rekombinasi Lokasi-Spesifik.” Ulasan Tahunan, Tersedia di sini.
Kesopanan Gambar:
- “SUrot” Oleh Juergen Bode – Pekerjaan sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
- “STswap” Oleh Juergen Bode – Pekerjaan sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia