Pengertian mutasi somatik

Mutasi somatik adalah mutasi yang diperoleh oleh sel-sel non-germline dan tidak dapat diwarisi oleh keturunan organisme induk dari sel yang bermutasi, dengan pengecualian, misalnya, tumor kelamin yang dapat ditransmisikan canine.

Mutasi somatik penting dalam keragaman antibodi, reseptor sel T, dan reseptor sel B. Mereka sering disebabkan oleh faktor lingkungan dan terakumulasi dalam DNA dari organisme apa pun meskipun mekanisme perbaikan DNA mahir. Mutasi somatik hadir dalam jaringan sehat pada frekuensi sekitar 2-6 mutasi per juta basis, dan sekitar tiga mutasi somatik per individu manusia yang sehat.

Sebagai konsekuensinya, sel somatik menghadirkan genotipe berbeda dalam individu yang sama, sebuah fenomena luas dalam perkembangan dan penuaan yang sehat, yang dikenal sebagai mosaikisme somatik. Mutasi somatik menumpuk selama proses penuaan. Zhang L et al, menggunakan sekuensing seluruh genome Single Displacement Amplplacement Amplification, menemukan bahwa jumlah mutasi somatik dalam limfosit B manusia meningkat dari <500 per sel pada bayi baru lahir menjadi> 3.000 per sel dalam centenarian.

Implikasi dari mosaikisme pada penyakit tidak sepenuhnya dipahami, tetapi penelitian terbaru menunjukkan bahwa itu mempengaruhi kanker, gangguan neurologis dan neuropsikiatri, dan berbagai gangguan monogenik. Pada sel kanker, mutasi semacam itu ditemukan pada frekuensi tinggi.

Dalam ulasan oleh Martincorena dan Campbell (2015) dinyatakan bahwa antara 1.000 dan 20.000 mutasi titik dan ratusan penyisipan, penghapusan dan pengaturan ulang dapat dideteksi pada kanker. Angka-angka ini ditentukan berdasarkan penelitian pada jutaan mutasi pada berbagai jenis kanker. COSMIC (Katalog Mutasi Somatik Dalam Kanker) versi 90, dirilis pada September 2019, mencakup hampir 29.519.920 mutasi pengkodean melintasi 1.412.466 sampel tumor, dikuratori dari 26.829 publikasi.

Mutasi somatik tidak direduksi menjadi mutasi titik tetapi dapat berupa variasi genomik: pengulangan, penghapusan, penyisipan, penggandaan, kehilangan nomor salinan, dan lainnya. Mutasi somatik kromosom terjadi ketika sel somatik membelah. Selama waktu ini, penyimpangan struktural hasil dari kerusakan kromosom dan perbaikan yang salah atau pertukaran materi yang tidak merata selama pemisahan kromosom. Penyimpangan struktural termasuk penghapusan, ketika bagian dari kromosom hilang; duplikasi ketika sebagian kromosom muncul dua kali; translokasi ketika materi genetik telah dipertukarkan antara kromosom atau inversi non-homolog, ketika bagian dari kromosom berada dalam orientasi terbalik. Karena perubahan tersebut hanya terjadi pada beberapa sel, mosaik kromosom diamati.

Satu keprihatinan umum ketika mencoba mengidentifikasi dan mengkarakterisasi mutasi somatik adalah kelimpahannya yang rendah. Karena frekuensi rendah, mutasi somatik sulit dideteksi dalam sampel jaringan massal, dan amplifikasi DNA templat diperlukan sebelum analisis. Namun, amplifikasi DNA adalah proses rawan kesalahan, dan mutasi nyata mungkin tersembunyi di antara kesalahan ini. Bahkan teknologi sekuensing modern gagal mendeteksi banyak varian somatik, terutama yang hadir dalam jumlah sangat sedikit atau satu salinan. Kesalahan pengurutan cukup tinggi untuk menutupi variasi nyat. Metode sensitif diperlukan untuk deteksi dan kuantifikasi relatif mutasi somatik dalam bahan biologis.

Karena berbagai jenis mutasi dan kesulitan yang disebutkan di atas dalam mendeteksi mutasi somatik, berbagai teknik telah dan terus dikembangkan. Metode PCR, elektroforetik, kromatografi, dan pengurutan paling umum digunakan untuk mendeteksi mutasi titik yang diketahui (untuk diagnosis) atau tidak diketahui. Untuk ini, metode menyelidik ditambahkan untuk mendeteksi penyimpangan kromosom. Metode deteksi dapat spesifik untuk daerah kromosom yang ditargetkan atau digunakan untuk seluruh eksome, misalnya, dalam studi tumor kelamin yang ditransmisikan canine [6], seluruh genom atau analisis transkriptome.

Di sini kami menyajikan metode klasik dan modern untuk identifikasi variasi somatik. Setiap metode dijelaskan secara singkat, dan studi yang berhasil menggunakannya dicontohkan. Daftar ini mencakup teknik yang umum digunakan, tanpa dianggap lengkap. Saat teknologi baru sedang dikembangkan, mereka ditambahkan ke koleksi ini. Tabel 1 memberikan ringkasan membahas kegunaan, sensitivitas dan beberapa kelebihan dan kekurangan.

Mutasi somatik, perubahan genetik yang diperoleh sel yang dapat ditularkan ke keturunan sel yang bermutasi dalam perjalanan pembelahan sel. Mutasi somatik berbeda dari mutasi garis kuman, yang merupakan perubahan genetik bawaan yang terjadi pada sel-sel kuman (yaitu, sperma dan telur). Mutasi somatik sering disebabkan oleh faktor lingkungan, seperti paparan radiasi ultraviolet atau bahan kimia tertentu.

Mutasi somatik dapat terjadi pada setiap pembelahan sel mulai dari pembelahan pertama sel telur yang dibuahi hingga pembelahan sel yang menggantikan sel dalam individu yang pikun. Mutasi mempengaruhi semua sel yang diturunkan dari sel yang bermutasi. Bagian utama dari suatu organisme, seperti cabang pohon atau lapisan jaringan lengkap hewan, dapat membawa mutasi; itu mungkin atau mungkin tidak diungkapkan secara jelas. Mutasi somatik dapat menimbulkan berbagai penyakit, termasuk kanker.

Mutasi somatik adalah mutasi genetik yang terjadi pada sel somatik setelah pembuahan. Mutasi somatik dapat menyebabkan berbagai masalah medis, dan orang awam sering mengasosiasikan mereka khusus dengan kanker.

Mutasi somatik dapat diidentifikasi dengan memeriksa materi genetik dalam sel yang diragukan dan membandingkannya dengan sel dari tempat lain di tubuh, DNA dalam dua sel akan berbeda, meskipun fakta bahwa itu tidak seharusnya.

Ada dua jenis sel: sel somatik dan sel-sel germinal. Sel germinal akhirnya menimbulkan gamet, sedangkan sel somatik menimbulkan segala sesuatu yang lain. Jika mutasi somatik terjadi di dalam rahim, semua sel berasal dari sel somatik akan membawa mutasi. Ini hasil dalam situasi yang disebut mosaik genetik, di mana beberapa sel dalam tubuh seseorang memiliki DNA yang berbeda dari sel-sel lain.

Mutasi somatik dalam rahim dapat menyebabkan masalah seperti cacat lahir, dengan sel gangguan lewat di DNA yang rusak kepada turunannya dan menyebabkan malformasi. Dalam kasus lain, seseorang dapat dibiarkan dengan mosaik, tapi tidak ada masalah luar. Setelah lahir, mutasi somatik dapat mengarah pada perkembangan kanker jika regulator pertumbuhan sel yang rusak, menyebabkan sel untuk terlibat dalam replikasi tidak terkontrol, menciptakan sel-sel baru yang akan melakukan hal yang sama.

Mutasi somatik tidak dapat diwariskan, karena mereka tidak melibatkan sel-sel germinal. Jenis mutasi ini kadang-kadang disebut “acquired mutation,” fakta referensi bahwa itu bukan hasil dari pewarisan mutasi dari orangtua. Sebagai contoh, seorang wanita yang mengembangkan kanker payudara tidak akan memberikan kanker payudara pada anaknya. Namun, risiko dari mutasi somatik dapat ditingkatkan dengan ada atau tidaknya gen warisan tertentu, yang berarti bahwa anak-anak dari wanita dengan kanker payudara mungkin pada peningkatan risiko, dan mereka dapat diuji untuk mengetahui apakah gen terkait dengan kanker payudara yang hadir dalam DNA mereka.

Mutasi somatik dapat terjadi karena berbagai alasan. Beberapa tampaknya hasil dari paparan racun atau radiasi yang mengganggu proses pembelahan sel. Lainnya adalah spontan, terjadi sebagai hasil dari kesalahan acak dalam proses pembelahan sel. Mengingat panjang genom, kesalahan sesekali bisa terjadi dalam sel-sel individual, dan pada kenyataannya tubuh adalah menyandi untuk menghancurkan sel-sel somatik yang telah bermutasi, meskipun tidak selalu berhasil.

Kesimpulan

Mutasi somatik adalah perubahan dalam DNA yang terjadi setelah pembuahan. Mutasi somatik dapat terjadi pada salah satu sel tubuh kecuali sel kuman (sperma dan sel telur) dan karenanya tidak diturunkan ke anak-anak. Perubahan-perubahan ini dapat (tetapi tidak selalu) menyebabkan kanker atau penyakit lainnya.


Tinggalkan Balasan

Alamat email Anda tidak akan dipublikasikan. Ruas yang wajib ditandai *