Perbedaan yang jelas dari mereka, knockout gen dan knockdown yaitu knockout gen adalah teknik di mana gen yang diminati sepenuhnya dihapus (keadaan tidak beroperasi) untuk mempelajari fungsi gen sedangkan knockdown gen adalah teknik lain di mana gen yang diminati dibungkam untuk diselidiki.
peran gen tertentu dalam sistem biologis.
Berbagai teknik genetik sedang beroperasi untuk menyelidiki fungsi gen dalam sistem biologis yang hidup.
KO gen dan knockdown adalah dua teknik semacam itu.
Teknik-teknik ini membantu para ilmuwan untuk mengidentifikasi aspek fungsional gen yang berbeda dalam organisme hidup.
ISI
- Ikhtisar dan Perbedaan Utama 2.
Apa itu Gene Knockout3.
Apa itu Gene Knockdown4.
Kesamaan Antara Gene Knockout dan Knockdown5.
Perbandingan Berdampingan – Gene Knockout & Knockdown dalam Bentuk Tabular6.
Ringkasan _
Pengertian Gene Knockout?
KO gen, merupakan istilah yang mengacu pada teknik genetik yang membuat satu atau lebih gen tidak berfungsi dalam organisme hidup.
Ini juga merupakan proses mematikan atau menghapus gen suatu organisme.
Aplikasi utama dari teknik ini adalah untuk mempelajari fungsi gen.
Proses mengevaluasi efek dari gen yang hilang atau dihilangkan.
Proses knockout juga melibatkan enzim tertentu dan teknik penyambungan.
Ada beberapa variasi dalam teknik knockout gen berdasarkan jumlah gen yang terlibat.
Mereka adalah double knockout (KO dua gen), triple knockout (KO tiga gen) dan quadruple knockout (KO empat gen).
KO gen selanjutnya diklasifikasikan menjadi dua kelompok; KO heterozigot dan KO homozigot.
Pengertian Gene Knockdown?
Knockdown gen, merupakan istilah yang mengacu pada prosedur eksperimental di mana prosedur ini menekan atau mengurangi ekspresi gen atau gen tertentu dari suatu organisme.
Pembungkaman gen adalah definisi umum untuk knockdown gen.
Selama prosedur ini, aktivasi atau degradasi mRNA yang dihasilkan melibatkan interferensi RNA (RNAi), RNA interferensi kecil (siRNA) dan RNA jepit rambut pendek (shRNA).
Penggunaan utama knockdown gen adalah untuk menyelidiki peran gen tertentu dalam sistem biologis.
Oleh karena itu, teknik ini menyelesaikan studi tentang onkogen (Bcl-2 dan P53) dan gen yang menyebabkan penyakit saraf, infeksi virus, dan penyakit keturunan.
Apa Persamaan Antara Gene Knockout dan Knockdown?
- Baik knockout gen dan knockdown gen, merupakan istilah yang mengacu pada teknik genetik.
- Kedua teknik ini dapat mencegah ekspresi gen.
- Penggunaan utama kedua teknik tersebut adalah untuk menyelidiki fungsi gen yang diinginkan.
- Keduanya mampu mengidentifikasi kondisi penyakit yang berbeda (genetik).
- Keduanya dapat digunakan untuk satu atau lebih gen yang diminati.
Apa Perbedaan Antara Gene Knockout dan Knockdown?
Gene Knockout & Knockdown |
|
|
KO gen, merupakan istilah yang mengacu pada pengoperasian gen (penghapusan gen dari DNA) suatu organisme melalui teknik genetik yang berbeda. |
Knockdown gen adalah prosedur eksperimental untuk menekan (mengurangi atau membungkam) ekspresi gen atau gen tertentu dari suatu organisme. |
|
Fungsi |
|
|
Memfasilitasi studi tentang fungsi gen dengan menganalisis hasil gen yang hilang. |
Memfasilitasi studi tentang onkogen, gen yang menyebabkan penyakit saraf, infeksi virus, dan penyakit keturunan. |
|
Keterlibatan Agen RNA |
|
|
Keterlibatan agen RNA tidak signifikan dalam teknik ini. |
Proses tersebut melibatkan agen seperti siRNA, shRNA, dan RNAi untuk menonaktifkan mRNA. |
|
Penggunaan Agen Kimia |
|
|
Agen enzimatik digunakan. |
Tidak ada bahan kimia seperti itu yang digunakan. |
|
Efek pada Gen |
|
|
Benar-benar menghilangkan gen dari DNA. |
Menekan atau membungkam gen. |
|
Klasifikasi |
|
|
KO ganda, KO tiga kali lipat, dan KO empat kali lipat, serta KO heterozigot dan homozigot adalah jenis KO gen yang berbeda. |
Tidak ada sistem klasifikasi yang tersedia untuk pembungkaman gen. |
Ringkasan – Gene Knockout & Gene Knockdown
Dua teknik yang kita diskusikan di sini; knockout dan knockdown gen,, merupakan istilah yang mengacu pada metode untuk menyelidiki fungsi gen yang berbeda.
KO gen sepenuhnya membuat gen tidak berfungsi sementara gen knockdown membungkam gen yang diinginkan.
Namun, kedua prosedur tersebut mencegah ekspresi gen.
Agen yang berbeda mampu menyelesaikan kedua proses ini.
Knock out gen adalah jenis penghapusan sedangkan knockdown gen adalah jenis inaktivasi.
Inilah perbedaan antara gen knock out dan knockdown.
Referensi:
1.Shaffer, Catherine.
“Gene Knockout versus Knockdown.” News-Medical.net, 12 Februari 2018.
Tersedia di sini 2.
“Gene Knockout.” Berita Alam, Grup Penerbitan Alam.
Tersedia disini
Kesopanan Gambar:
1.’Knockout Mice5006-300’Oleh Maggie Bartlett, NHGRI.
(Domain Publik) via Commons Wikimedia 2.’RNAi-disederhanakan’Oleh Matzke MA, Matzke AJM (2004) Menanam Benih Paradigma Baru.
PLoS Biol 2(5): e133 doi:10.1371/journal.pbio.0020133., (CC BY 2.5) melalui Commons Wikimedia