Fungsi utama nefron adalah membuang semua produk limbah termasuk limbah padat, dan kelebihan air lainnya dari darah, mengubah darah menjadi urin, reabsorpsi, sekresi, dan ekskresi berbagai zat.
Saat darah melewati glomerulus dengan tekanan tinggi, molekul-molekul kecil dipindahkan ke kapsul glomerulus dan berjalan melalui serangkaian tubulus yang berliku.
Sel yang ada di setiap tabung menyerap molekul yang berbeda tidak termasuk glukosa, air, dan molekul bermanfaat lainnya yang disebut sebagai ultrafiltrat. Saat molekul ultrafiltrat berjalan menuruni tubulus, mereka menjadi semakin hipertonik, yang menghasilkan lebih banyak air yang akan diekstraksi dari ultrafiltrat sebelum keluar dari nefron.
Darah yang mengelilingi nefron mengalir kembali ke tubuh melalui pembuluh darah ginjal, yang bebas dari racun dan zat berlebih lainnya. Ultrafiltrat yang diperoleh adalah urin, yang mengalir ke bawah melalui saluran pengumpul ke kandung kemih, di mana ia akan disimpan dan dikeluarkan melalui uretra.