Perbedaan yang jelas dari mereka, CGH dan array CGH yaitu CGH adalah metode sitogenetik molekuler tradisional untuk menganalisis variasi nomor salinan dalam DNA dari sampel uji yang memiliki resolusi lebih rendah, sedangkan array CGH adalah metode sitogenetik molekuler otomatis untuk menganalisis variasi nomor salinan dalam DNA suatu sampel uji yang memiliki resolusi lebih tinggi. CGH dan array CGH adalah dua teknik untuk mendeteksi variasi nomor salinan pada individu.
Variasi nomor salinan adalah bagian genom yang diulang. Salin nomor bervariasi antara individu.
Variasi nomor salinan umumnya dikategorikan menjadi dua kelompok: pengulangan pendek dan pengulangan panjang. Salah satu contoh paling terkenal untuk variasi jumlah salinan pendek adalah pengulangan trinukleotida CAG pada gen berburu.
Ini menyebabkan gangguan saraf yang disebut huntingtin. Contoh terbaik untuk variasi jumlah pengulangan panjang adalah gen alfa amilase, yang menyebabkan resistensi insulin.
Variasi nomor salinan dapat dideteksi dengan teknik seperti FISH, CGH, dan array CGH.
ISI
- Gambaran Umum dan Perbedaan Utama 2. Apa itu CGH 3.
Apa itu Array CGH4. Kemiripan – CGH dan Array CGH 5.
CGH & Array CGH dalam Bentuk Tabular6. Ringkasan – CGH & Array CGH
Pengertian CGH?
CGH, merupakan istilah yang mengacu pada metode sitogenetik molekuler tradisional untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA sampel uji dibandingkan dengan sampel referensi.
Ini memiliki resolusi yang lebih rendah dibandingkan dengan teknik otomatis. Tujuan dari teknik ini adalah dengan cepat dan efisien membandingkan dua sampel DNA genom yang muncul dari sumber yang berbeda.
Prosedur ini melibatkan isolasi DNA dari dua sumber: tes dan referensi. Kemudian langkah selanjutnya adalah pelabelan independen sampel DNA uji dan referensi dengan fluorofor dengan warna berbeda.
Kemudian, kedua sampel DNA tersebut didenaturasi untuk mendapatkan sampel DNA beruntai tunggal. Akhirnya, dilakukan hibridisasi dari dua sampel DNA yang dihasilkan dalam rasio 1:1 dengan penyebaran kromosom metafase normal.
Perbedaan kromosom dapat diidentifikasi antara dua sumber menggunakan mikroskop fluoresensi dan perangkat lunak komputer. Selain itu, teknik CGH hanya mampu mendeteksi kelainan kromosom yang tidak seimbang.
Pengertian Array CGH?
Array CGH, merupakan istilah yang mengacu pada metode sitogenetik molekuler yang sepenuhnya otomatis untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA sampel uji dibandingkan dengan sampel referensi. Ini memiliki resolusi yang lebih tinggi, dan dikembangkan untuk meminimalkan keterbatasan CGH tradisional.
Array CGH menggabungkan prinsip-prinsip CGH dengan penggunaan microarray. Alih-alih menggunakan penyebaran kromosom metafase, metode ini menggunakan slide yang disusun dengan segmen kecil DNA sebagai target.
Microarray ini dibuat dengan mendepositkan dan melumpuhkan sejumlah kecil DNA (probe) pada penyangga kaca padat. Ukuran probe dapat bervariasi dari oligonukleotida hingga kromosom buatan bakteri.
Terlepas dari probe, metode dasar array CGH mirip dengan CGH. Setelah probe yang mengandung microarray disiapkan, dua sampel DNA (uji dan referensi) yang diberi label dengan fluorofor dengan warna berbeda dicampur bersama dan ditambahkan ke microarray.
Karena DNA dalam sampel adalah beruntai tunggal karena denaturasi, DNA ini berhibridisasi dengan probe beruntai tunggal yang tersusun. Dengan menggunakan sistem pencitraan digital, dimungkinkan untuk mengidentifikasi perbedaan kromosom antara kedua sumber.
Apa Persamaan Antara CGH dan Array CGH?
- CGH dan array CGH, merupakan istilah yang mengacu pada dua teknik untuk mendeteksi variasi nomor salinan.
- Mereka adalah metode sitogenetik molekuler.
- Kedua metode mendiagnosis kelainan kromosom yang tidak seimbang.
- Fluorofor terlibat dalam kedua metode.
- Kedua metode tersebut dapat digunakan untuk mendeteksi kelainan genetik akibat variasi jumlah salinan.
- Mereka banyak digunakan dalam analisis genom komparatif.
Apa Perbedaan Antara CGH dan Array CGH?
CGH, merupakan istilah yang mengacu pada metode sitogenetik molekuler tradisional untuk menganalisis variasi nomor salinan dalam DNA sampel uji yang memiliki resolusi lebih rendah, sedangkan susunan CGH adalah metode sitogenetik molekuler otomatis penuh untuk menganalisis variasi nomor salinan dalam DNA sampel uji yang memiliki resolusi lebih tinggi. Jadi, inilah perbedaan utama antara CGH dan array CGH.
Selanjutnya, dalam CGH, sampel DNA uji dan referensi berhibridisasi dengan penyebaran kromosom metafase normal, tetapi dalam susunan CGH, sampel DNA uji dan referensi berhibridisasi dengan probe DNA amobil yang mengandung microarray. Infografis di bawah ini mencantumkan perbedaan antara CGH dan array CGH dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – CGH & Array CGH
CGH dan array CGH, merupakan istilah yang mengacu pada dua teknik sitogenetik molekuler untuk mendeteksi kelainan kromosom yang tidak seimbang. Mereka banyak digunakan dalam analisis genom komparatif.
CGH adalah metode sitogenetik molekuler tradisional untuk menganalisis variasi nomor salinan dalam DNA dari sampel uji yang memiliki resolusi lebih rendah. Sebaliknya, array CGH adalah metode sitogenetik molekuler yang sepenuhnya otomatis untuk menganalisis variasi nomor salinan dalam DNA dari sampel uji yang memiliki resolusi lebih tinggi.
Jadi, ini merangkum perbedaan antara CGH dan array CGH.
Referensi:
- “Hibridisasi Genomik Komparatif.” Gambaran Umum | Topik ScienceDirect. 2.
Heather, James M., dan Benjamin Chain. “Urutan Pengurut: Sejarah Pengurutan DNA.” Genomics, Academic Press, 10 November 2015.
Kesopanan Gambar:
- “Skema CGH” Oleh Mbaudis (bicara) (Unggah) – Pekerjaan sendiri (CC BY 2.5) melalui Commons Wikimedia 2.
“Protokol Array-CGH” Oleh Philippe Hupé – Emmanuel Barillot, Laur ence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Biologi Sistem Komputasi Kanker Chapman & Biologi Komputasi Matematika “Hall / CRC”, 2012 (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia