Perbedaan yang jelas dari mereka, helix-loop-helix dan helix-turn-helix merupakan helix-loop-helix memediasi dimerisasi protein sedangkan helix-turn-helix mengatur ekspresi gen melalui pengikatan DNA.
Motif protein adalah urutan pendek yang diasosiasikan dengan fungsi DNA yang berbeda.
Ini terutama terkait dengan situs struktural khusus dengan fungsi kimia atau biologis yang unik.
Motif ini mengandung daerah kecil dari struktur tiga dimensi asam amino dengan molekul protein yang berbeda.
Biasanya motif individu hanya mengandung sedikit unsur.
Helix-loop-helix dan helix-turn-helix mengandung tiga elemen.
Motif struktural protein mereka termasuk loop dengan panjang bervariasi dan struktur yang tidak ditentukan.
ISI
- Ikhtisar dan Perbedaan Utama 2.
Apa itu Helix-Loop-Helix 3.
Apa itu Helix-Turn-Helix4.
Kemiripan – Helix-Loop-Helix dan Helix-Turn-Helix5.
Helix-Loop-Helix & Helix-Turn-Helix dalam Bentuk Tabular6.
Ringkasan – Helix-Loop-H elix & Helix-Turn-Helix
Pengertian Helix-Loop-Helix?
Helix-loop-helix (HLH), merupakan istilah yang mengacu pada motif struktural protein yang mendefinisikan salah satu keluarga terbesar dari faktor transkripsi dimerisasi.
Faktor transkripsi ini mengandung residu asam amino untuk memfasilitasi mekanisme pengikatan DNA, dan bersifat dimerik.
Motif struktural protein mengandung dua heliks α, dan keduanya dihubungkan oleh sebuah loop.
Satu heliks tampak lebih kecil dari dua heliks, dan fleksibilitas loop memungkinkan dimerisasi dengan mengemas dan melipat heliks lainnya.
Heliks yang tampak lebih besar biasanya mengandung daerah pengikat DNA.
Protein HLH mengikat urutan konsensus yang dikenal sebagai E-box.
Urutan konsensus adalah urutan terhitung yang mengandung residu nukleotida atau asam amino.
E-box adalah elemen yang merespons DNA pada beberapa eukariota yang bertindak sebagai tempat pengikatan protein dan mengatur ekspresi gen.
Faktor transkripsi HLH sangat penting untuk perkembangan dan aktivitas sel.
Protein HLH sebagian besar termasuk dalam enam kelompok, yang ditunjukkan dari huruf A hingga F.
Faktor transkripsi yang termasuk dalam setiap kelompok adalah:
Grup A: MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD, dan Neurogenin,
grup B: MAX, C-Myc, N-Myc, dan TCF4
Grup C: AhR, BMAL-1-CLOCK, HIF, NPAS1, NPAS3, dan MOP5
Grup D; EMC
Grup E: HEY1 dan HEY2
Grup F: EBF1
Karena sebagian besar faktor transkripsi HLH bersifat heterodimerik, dimerisasi sering mengaturnya.
Pengertian Helix-Turn-Helix?
Helix-turn-helix (HTH), merupakan istilah yang mengacu pada motif struktural protein yang mampu mengikat DNA.
Setiap monomer diatur dengan dua heliks α dan dihubungkan oleh untaian asam amino pendek.
Ini berikatan dengan alur di heliks DNA.
Motif HTH biasanya mengatur ekspresi gen.
Pengenalan HTH dan pengikatan pada DNA dilakukan oleh dua heliks α.
Satu heliks menempati ujung N-terminal sementara yang lain di C-terminus.
Dalam kebanyakan skenario, heliks melakukan pengenalan DNA.
Oleh karena itu, ini dikenal sebagai heliks pengenalan.
Pengikatan alur pada DNA terjadi melalui serangkaian interaksi Van der Waals dan ikatan hidrogen dengan basa yang terbuka.
α-helix lainnya menstabilkan interaksi protein dan DNA dan tidak memainkan peran utama dalam pengenalan.
Namun, heliks pengenalan dan heliks yang tersisa memiliki orientasi yang serupa.
HTH diklasifikasikan menurut struktur dan tata ruang heliks.
Jenis utamanya adalah HTH di-heliks, tri-heliks, tetra-heliks, dan bersayap.
Tipe di-heliks adalah tipe paling sederhana dengan dua heliks dan domain protein lipat independen.
Jenis tri-heliks ditemukan dalam aktivator transkripsi Myb.
Jenis tetra-heliks memiliki heliks C-terminal tambahan.
Akhirnya, HTH bersayap dibentuk oleh 3- bundel heliks dan 3- atau 4- untai lembaran beta.
Apa Persamaan Antara Helix-Loop-Helix dan Helix-Turn-Helix?
- Helix-loop-helix dan helix-turn-helix, merupakan istilah yang mengacu pada motif struktural protein.
- Keduanya mengandung penyebut yang sama dalam faktor transkripsi basal dan spesifik.
- Mereka hadir dalam eukariota.
Apa Perbedaan Antara Helix-Loop-Helix dan Helix-Turn-Helix?
Helix-loop-helix memediasi dimerisasi protein, sedangkan helix-turn-helix mengatur ekspresi gen melalui pengikatan DNA.
Jadi, ini, merupakan istilah yang mengacu pada perbedaan utama antara helix-loop-helix dan helix-turn-helix.
Selain itu, HLH mengandung proto-onkogen dan gen tertentu yang terlibat dalam faktor transkripsi pengkodean diferensiasi sementara HTH mengandung banyak gen homeotik yang mengkode faktor transkripsi.
Selain itu, helix-loop-helix terutama terdiri dari heliks alfa yang dihubungkan oleh sebuah loop, sedangkan helix-turn-helix terutama terdiri dari loop yang dihubungkan oleh dudukan asam amino pendek yang membentuk alur.
Infografis di bawah ini menyajikan perbedaan antara helix-loop-helix dan helix-turn-helix dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Helix-Loop-Helix & Helix-Turn-Helix
Motif protein, merupakan istilah yang mengacu pada urutan pendek yang diasosiasikan dengan fungsi DNA yang berbeda.
Helix-loop-helix dan helix-turn-helix adalah dua jenis motif struktur protein.
Perbedaan yang jelas dari mereka, helix-loop-helix dan helix-turn-helix adalah helix-loop-helix memediasi dimerisasi protein, sedangkan helix-turn-helix mengatur ekspresi gen melalui pengikatan DNA.
HLH adalah motif struktural protein yang mendefinisikan salah satu keluarga terbesar dari faktor transkripsi dimerisasi.
Motif struktural protein mengandung dua heliks α, dan keduanya dihubungkan oleh sebuah loop.
HTH adalah motif struktural protein yang mampu mengikat DNA.
Setiap monomer diatur dengan dua heliks α, dan bergabung dengan untaian asam amino pendek dan berikatan dengan alur di heliks DNA.
Jadi, ini merangkum perbedaan antara helix-loop-helix dan helix-turn-helix.
Referensi:
- “Helix-Loop-Helix Dasar.” Gambaran Umum | Topik ScienceDirect.
2.
“Helix-Turn-Helix.” Gambaran Umum | Topik ScienceDirect.
Kesopanan Gambar:
- “Basic helix loop helix” Oleh I, Splette (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia 2.
“Penyelarasan HTH dari 3 anggota keluarga TetR” Oleh Gabbiochem – menggunakan PyMol berdasarkan PDB: 5DY0 disimpan oleh Palanca & Rubio, PDB: 3VIB disimpan oleh Kuma raswami, Shafer, “Brennan, dan PDB: 3ZQL disimpan oleh Le, Schumacher, Lawson, Brennan”; Buttner (CC BY 3.0) melalui Commons Wikimedia