Perbedaan antara endonuklease dan eksonuklease terletak pada peran dan lokasi kerjanya dalam pemotongan dan penguraian rantai DNA. Berikut adalah perbedaan antara endonuklease dan eksonuklease:
- Definisi: Endonuklease adalah enzim yang memotong rantai DNA di dalam molekul tersebut, sedangkan eksonuklease adalah enzim yang memotong rantai DNA dari ujung molekul tersebut.
- Lokasi Kerja: Endonuklease bekerja pada lokasi internal atau tengah molekul DNA. Enzim ini dapat memotong pada posisi tertentu dalam rantai DNA. Eksonuklease, di sisi lain, bekerja pada ujung molekul DNA. Enzim ini dapat memotong dari salah satu ujung rantai DNA.
- Fungsi: Endonuklease berperan dalam banyak proses biologis, termasuk pemotongan DNA selama proses replikasi, pemotongan DNA selama proses reparasi kerusakan DNA, dan pemotongan DNA selama proses transkripsi gen. Eksonuklease berperan dalam pemotongan atau degradasi DNA yang rusak, tidak berguna, atau tidak diperlukan.
- Contoh: Contoh endonuklease termasuk restriksi enzim yang digunakan oleh bakteri untuk memotong DNA asing sebagai respons terhadap infeksi virus. Contoh eksonuklease termasuk enzim eksisi yang memotong ujung DNA yang rusak atau terdegradasi selama proses reparasi DNA.
Dalam ringkasan, endonuklease memotong DNA pada lokasi internal atau tengah molekul, sementara eksonuklease memotong DNA dari ujung molekul. Endonuklease terlibat dalam berbagai proses biologis, sementara eksonuklease berfungsi dalam pemotongan atau degradasi DNA yang rusak atau tidak berguna.
Perbedaan mendasar – Endonuclease & Exonuclease
Sebelum melihat perbedaan antara endonuklease dan eksonuklease, penting untuk mengetahui apa sebenarnya nuklease itu.
Nuklease merupakan enzim yang mampu membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida dalam asam nukleat.
Endonuclease dan exonuclease, merupakan istilah yang mengacu pada dua klasifikasi nuklease.
Perbedaan yang jelas dari mereka, endonuklease dan eksonuklease adalah endonuklease membelah ikatan antara nukleotida dalam molekul asam nukleat sedangkan eksonuklease membelah ikatan antara nukleotida pada ujung 3 ‘atau 5’ dari molekul asam nukleat.
ISI 1.
Ikhtisar dan Perbedaan Utama2.
Apa itu Nuclease3.
Apa itu Endonuklease 4.
Apa itu Eksonuklease5.
Perbandingan Berdampingan – Endonuclease & Exonuclease6.
Ringkasan
Pengertian Nuklease?
Nuklease, merupakan istilah yang mengacu pada enzim yang memiliki kemampuan untuk memotong ikatan fosfodiester antara nukleotida dalam asam nukleat.
Itu milik kelompok enzim hidrolase karena menghidrolisis ikatan kimia antara nukleotida.
Enzim ini sangat penting untuk mekanisme perbaikan DNA alami yang terjadi di dalam sel dan dalam proses bioteknologi seperti kloning gen, teknologi DNA rekombinan, RFLP, AFLP, pengurutan gen, terapi gen, pemetaan genom, dll.
Ada dua jenis nuklease utama: ribonuklease dan deoksiribonuklease, yang masing-masing bertindak dan memutus ikatan kimia antara monomer RNA dan DNA.
Menurut tempat kerja nuklease, mereka selanjutnya dikategorikan menjadi dua kelompok yaitu endonuklease dan eksonuklease.
Endonuklease mengenali daerah sekuens spesifik asam nukleat dan membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida yang terletak di tengah asam nukleat.
Exonucleases membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida yang terletak di ujung asam nukleat.
Pengertian Endonuklease?
Endonuklease, merupakan istilah yang mengacu pada jenis nuklease yang membelah asam nukleat dari tengah.
Ini mengenali urutan nukleotida spesifik dari asam nukleat dan memutus ikatan kimia antara nukleotida.
Mereka juga dikenal sebagai endonuklease restriksi karena mereka mencari situs restriksi spesifik dan membelah ikatan dan menghasilkan fragmen restriksi.
Lebih dari 100 endonuklease restriksi diidentifikasi pada bakteri dan archaea dan diperoleh untuk tujuan komersial.
Endonuklease restriksi banyak digunakan dalam bioteknologi.
Mereka memainkan peran penting dalam kloning molekuler.
Kebanyakan dari mereka adalah enzim dimer yang terdiri dari dua subunit protein.
Dua subunit protein membungkus DNA beruntai ganda dan secara terpisah membelah kedua untai dari kedua sisi.
Ada ratusan jenis endonuklease restriksi dengan situs pengenalan unik pada bakteri.
Karena spesifisitasnya yang tinggi dalam pembatasan, mereka membelah hanya pada urutan tertentu.
Oleh karena itu, mereka dianggap sebagai alat molekuler yang sangat berguna dalam teknologi DNA rekombinan.
Tanpa endonuklease restriksi, produksi molekul DNA rekombinan tidak mungkin dilakukan.
Penciptaan molekul DNA rekombinan adalah langkah dasar dari sebagian besar teknologi biologi molekuler.
Untuk memahami pengenalan urutan yang unik oleh restriksi endonuklease, contoh berikut akan membantu para pembaca.
Bam HI adalah endonuklease restriksi yang mencari situs restriksi berikut dalam molekul DNA (situs ditunjukkan dengan huruf merah).
Setelah Bam HI membelah asam nukleat dari situs restriksi, ia menghasilkan dua fragmen berikut.
EcoRI adalah endonuklease restriksi lain yang sangat berguna dalam teknologi DNA rekombinan yang bekerja pada situs pengenalan restriksi spesifiknya dan membelah DNA seperti yang ditunjukkan pada Gambar 2.
Pengertian Eksonuklease?
Exonuclease, merupakan istilah yang mengacu pada enzim nuklease yang memotong ikatan kimia antara nukleotida pada ujung 3 ‘atau 5’ dari rantai asam nukleat.
Ini memecah nukleotida tunggal di ujung rantai dan menghasilkan nukleosida dengan mentransfer gugus fosfat ke air.
Exonucleases ditemukan di archaea, bakteri, dan eukariota.
Dalam E coli, terdapat 17 exonucleases yang berbeda termasuk DNA polymeras 1, 2 dan 3.
Beberapa DNA polimerase menunjukkan aktivitas proofreading exonuclease 3′ sampai 5′.
Exonucleases penting dalam perbaikan DNA, rekombinasi genetik, pencegahan terjadinya mutasi, stabilisasi genom dll.
Apa perbedaan antara Endonuclease dan Exonuclease?
Endonuklease & Eksonuklease |
|
|
Endonuklease, merupakan istilah yang mengacu pada jenis enzim nuklease yang memotong ikatan antara nukleotida dalam molekul asam nukleat. |
Exonuclease adalah sejenis enzim nuklease yang memotong ikatan antara nukleotida pada ujung 3 ‘atau 5’ dari molekul asam nukleat. |
|
Produk Akhir |
|
|
Endonuklease menghasilkan fragmen restriksi oligonukleotida |
Eksonukleotida menghasilkan nukleosida |
|
Fungsi |
|
|
Mereka memutuskan ikatan fosfodiester dan menghasilkan fragmen restriksi. Tapi mereka menghilangkan nukleotida satu per satu. |
|
Mereka menghilangkan nukleotida satu per satu dari ujung asam nukleat.
Contoh
Contohnya antara lain Bam HI, EcoRI, Hind III, Hpa I, Sma I,
Contohnya termasuk Exonuclease I, Exonuclease III, RecBCD (Exonuclease V), RecJ exonuclease, Exonuclease VIII/RecE, Exonuclease IX, Exonuclease T, Exonuclease X dll.
Ringkasan – Endonuclease & Exonuclease
Nuklease bertanggung jawab untuk memutus ikatan kimia fosfodiester antara nukleotida asam nukleat.
Nuklease dapat bekerja di dalam atau di ujung rantai asam nukleat.
Menurut tempat kerjanya, dua jenis nuklease utama ditemukan pada organisme.
Mereka, merupakan istilah yang mengacu pada endonuklease dan eksonuklease.
Endonuklease membelah nukleotida dari tengah rantai sementara eksonuklease membelah nukleotida dari ujung rantai asam nukleat.
Endonuklease sangat penting dalam teknologi DNA rekombinan karena mereka mengenali urutan basa spesifik dalam rantai asam nukleat dan memutus ikatan antar nukleotida.
Referensi: 1.
“Enzim restriksi.” Enzim restriksi | Artikel Akses Terbuka | Jurnal Akses Terbuka | Prosiding Konferensi | Editor | Penulis | Pengulas | peristiwa ilmiah.
Np, dan Web.
11 Maret 2017 2.Pingoud, Alfred, dan Albert Jeltsch.
“Struktur dan fungsi endonuklease restriksi tipe II.” Penelitian Asam Nukleat.
Oxford University Press, 15 September 2001.
Web.
11 Maret 20173.Lovett, Susan T.
“The exonucleases DNA dari Escherichia coli.” Eco Sal Plus.
Perpustakaan Kedokteran Nasional AS, Desember 2011.
Web.
11 Maret 2017
Image Courtesy: 1.
“Enzim Pembatasan Eco RI” Oleh Tinastella – Pekerjaan sendiri (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia2.”HR RecBCD Rec A”Oleh Emw2012 – Pekerjaan sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia