Perang di Bosnia (1991–1995) adalah kampanye genosida yang dilakukan oleh Tentara Rakyat Yugoslavia (JNA) dan oleh pasukan tidak teratur dan paramiliter Serbia terhadap penduduk Muslim negara itu. Perang ini disebabkan oleh pecahnya Yugoslavia. Sementara pemerkosaan terjadi di hampir setiap perang, konflik Bosnia unik karena peran pemerkosaan dalam upaya membasmi Muslim di negara itu. Sementara pemerkosaan biasanya merupakan tindakan sekunder dari tindakan militer, dalam perang Bosnia degradasi perempuan Muslim adalah salah satu tujuan utama konflik. Memperkosa mereka adalah bagian dari kampanye genosida terhadap Muslim, yang secara halus disebut “pembersihan etnis.” Pemerkosaan digunakan untuk secara sistematis mempermalukan dan meneror wanita Muslim dan Kroasia. Jumlah pasti insiden tidak diketahui, meskipun penyelidik Eropa menyatakan bahwa 20.000 wanita diperkosa pada tahun 1992.
Perkiraan korban tewas, pria dan wanita, berkisar antara 150.000 hingga 250.000. Seperti yang coba dijelaskan oleh penulis Beverly Allen, para pelaku tindakan keji ini menyiratkan logika yang dipelintir di mana tindakan pemerkosaan akan menghilangkan identitas budaya korban. Jika korban dihamili, dia akan ditahan cukup lama untuk memastikan bahwa dia tidak dapat menggugurkan janinnya dan keturunannya akan dianggap tidak kurang dari “seorang tentara Serbia kecil.” Karena wanita Muslim biasanya tidak melakukan hubungan seks sebelum menikah, trauma fisik dan emosional dari pemerkosaan membawa serta kemungkinan penolakan yang kuat dari masyarakat, hidup tanpa pernikahan, dan tidak memiliki anak. Namun, pemerkosaan tidak terbatas pada wanita-wanita ini, karena anak perempuan di bawah usia 12 tahun dan wanita di atas usia 60 tahun juga diserang. Kejahatan seks juga dilakukan terhadap laki-laki Bosnia di kamp-kamp penahanan, yang dipaksa melakukan tindakan seksual satu sama lain.
Tinjauan singkat tentang sejarah Balkan diperlukan untuk menjelaskan ketegangan di antara kelompok etnis yang berbeda karena ketegangan ini berasal dari masa Kekaisaran Ottoman. Turki Ottoman Islam mengalahkan Serbia dalam pertempuran Kosovo pada tahun 1389. Peristiwa memalukan ini sering disinggung dalam propaganda nasionalistik Serbia. Bosnia juga menjadi bagian dari Kekaisaran Ottoman, tetapi tidak sampai bertahun-tahun kemudian. Banyak orang Bosnia secara sukarela menjadi Muslim pada abad kelima belas dan keenam belas, tetapi budaya Muslim Bosnia mempertahankan perbedaan yang mencolok dari sebagian besar dunia Islam, sebagaimana dibuktikan dalam arsitekturnya serta kebiasaan dan gaya hidupnya.
Pada Maret 1992, Bosnia mendeklarasikan kemerdekaan. Meskipun Muslim, Serbia, dan Kroasia bergabung dalam menyerukan perdamaian, unit paramiliter JNA dan Serbia segera memulai serangan. Muslim Bosnia dan Kroasia dengan cepat kewalahan. Serangan dalam perang Serbia melawan Bosnia mengambil pola yang longgar. Karena mereka mengendalikan tentara, Serbia hampir memonopoli senjata, terutama artileri. Tentara Yugoslavia akan membombardir daerah-daerah yang tidak berdaya selama berhari-hari, kemudian pasukan paramiliter Serbia akan dikirim. Kelompok-kelompok paramiliter terdiri dari ultranasionalis Serbia, penjahat, dan pengangguran. Ketika pasukan ini tiba, mereka akan mengumpulkan dan mengeksekusi para pemimpin non-Serbia. Dalam beberapa kasus, seperti di Srebrenica, hampir semua pria Muslim dieksekusi dan kemudian dikubur di kuburan massal.
Dalam kasus lain, pria Muslim dan Kroasia dalam usia pertempuran dikirim ke kamp-kamp penahanan, di mana ribuan dari mereka meninggal akibat disiksa, dipukuli, dan kelaparan. Dengan perginya para pria, para wanita kemudian berada di bawah belas kasihan orang-orang Serbia. Ribuan wanita ini diperkosa. Pasukan tidak teratur sering menahan wanita Muslim selama berminggu-minggu atau berbulan-bulan di “kamp pemerkosaan” sementara mereka berulang kali diserang secara seksual. Perang tersebut ditandai dengan ketidakmampuan atau keengganan PBB dan masyarakat internasional untuk mengakui dan menghentikan kekejaman di Bosnia. Pemaparan berulang-ulang tentang kejahatan ini di media akhirnya memaksa pihak berwenang untuk mengakui masalahnya. Penjaga perdamaian PBB dikirim ke Bosnia tetapi tidak dapat menghentikan kekerasan. Pada bulan Desember 1995, Perjanjian Dayton ditandatangani.
Perjanjian damai ini mengakui batas-batas internasional Bosnia dan Herzegovina dan menyediakan dua pemerintahan yang kira-kira setara: Federasi Muslim-Kroasia Bosnia di Bosnia dan Herzegovina dan Republika Srpska Serbia-Bosnia. Pengadilan Kejahatan Internasional untuk bekas Yugoslavia (ICTY) dibentuk untuk mengadili kejahatan perang di sana. Pada tahun 2004, beberapa pelaku pemerkosaan, penyiksaan, dan perbudakan telah dihukum, tetapi yang lain seperti presiden Serbia Slobodan Milosevic masih diadili di depan pengadilan atau sedang mengajukan banding. Pada bulan Maret 2004, Milosevic hampir menjalani pertengahan persidangannya, tetapi Amerika Serikat masih mendesak Serbia untuk menyerahkan 16 penjahat perang yang didakwa ke pengadilan Perserikatan Bangsa-Bangsa.